Blast

O Blast (Basic Local Alignment Search Tools) [2], desenvolvido pelo NCBI (National Center for Biotechnology Information), é um conjunto de algoritmos de comparação de seqüências de nucleotídeos e amino-ácidos. Segmentos de uma seqüência são comparados com segmentos de outras seqüências e são atribuídos pontos (scores) que indicam o grau de similaridade entre os segmentos. Quanto mais alta é a pontuação, maior é o grau de similaridade. Assim, ao final de uma execução do Blast temos, para cada par de seqüências, zero ou mais scores, dependendo do quão semelhantes elas são.

Figura 1: Cálculo do raw score
Image Score_Calculation

A seguir serão descritos alguns termos relevantes ao estudo do Blast:

Ricardo Nishikido Pereira 2004-12-06